En 2003, il remporte un premier prix de musique de chambre baroque à l’unanimité et un premier prix de basse continue. Il est invité, la même année, à une session de musicologie à l’Académie de Villecroze. Premier Prix de clavecin, Sébastien Amadieu ne néglige pas dans sa pratique du clavier les répertoires d’aujourd’hui et consacre son mémoire d’analyse moderne à la pièce Hommage à Manuel de Falla composée par Michel Merlet en 1969 et qui fait partie de ses pièces favorites en concert. Il est régulièrement invité par des ensembles de musique ancienne comme continuiste et soliste, et sollicité fréquemment par les chanteurs comme chef de chant pour sa connaissance des opéras de Hændel et de la tragédie lyrique, particulièrement celle de Jean-Philippe Rameau.

Avec l’ensemble , il aborde avec le même plaisir les œuvres de la période baroque et contemporaine. Il invite régulièrement Laura Naudeix pour des spectacles mêlant le théâtre et la musique: Hændel da camera, le masque Cupid and Death de James Shirley mis en musique par Christopher Gibbons et Matthew Locke,  la tragédie Andromède de Pierre Corneille avec les intermèdes de Charpentier.